| Z纯晶 | 获得方式 |
| 一般Z | 完成伊利马的队长试炼 |
| 飞行Z | 进入最左上的洞穴，台座上获得 |
| 格斗Z | 完成哈拉的美乐美乐岛大考验 |
| 水Z | 完成水莲的队长试炼 |
| 火Z | 完成卡奇的队长试炼 |
| 草Z | 完成玛奥的队长试炼 |
| 岩石Z | 完成丽姿的阿卡拉岛大考验 |
| 电Z | 完成马玛内的队长试炼 |
| 冰Z | 卡璞村拉纳基拉山，奈克洛兹玛右侧山洞内最右边，台座上获得 |
| 毒Z | 击败骷髅队手下后，布尔美丽给予 |
| 地面Z | 完成哈普乌的波尼岛大考验 |
| 超能力Z | 进入沙漠后，按照：上-右-上-右 的顺序，在台座上获得 |
| 虫Z | 击败古兹马后，右手边宝箱内拾得 |
| 幽灵Z | 完成阿塞萝拉的队长试炼 |
| 龙Z | 打败杖尾鳞甲龙，完成龙属性试炼后，台座上获得 |
| 恶Z | 完成默丹的乌拉乌拉岛大考验 |
| 钢Z | 与马睿因对话剧情获得 |
| 妖精Z | 完成茉莉的队长试炼 |
| 皮卡丘Z | 帮助明星皮卡丘对战记者后获得 |
| 狙射树枭Z | 击败库兹马后，库库伊博士给予 备注：未选择御三家的Z纯晶，二周目与哈拉对战后获得 |
| 炽焰咆哮虎Z | 击败库兹马后，库库伊博士给予 备注：未选择御三家的Z纯晶，二周目与哈拉对战后获得 |
| 西狮海壬Z | 击败库兹马后，库库伊博士给予 备注：未选择御三家的Z纯晶，二周目与哈拉对战后获得 |
| 卡璞Z | 击败或收服卡璞・鸣鸣后拾得 备注：二周目 |
| 玛夏多Z | 带着玛夏多，去听涛酒店三楼左边第一间房，配饰店老板给予 |
| 阿罗雷Z | 带着雷丘（阿罗拉的样子）去大钢蛇船内，右边资深训练师给予 |
| 卡比兽Z | 带着卡比兽，去听涛酒店三楼左边第一间房，配饰店老板给予 |
| 伊布Z | 接受伊布行家影虎的任务，打倒各地的8位伊布训练师后与影虎对战获得 备注：二周目 |
| 梦幻Z | 带着梦幻，去听涛酒店三楼左边第一间房，配饰店老板给予 |
| 智皮卡Z | 携带小智的皮卡丘，与皮卡丘山谷最右边的皮卡丘对话后给予 |
| 杖尾鳞甲龙Z | 波尼旷野左上角的旷野洞窟内，台座上获得 备注：二周目 |
| 鬃岩狼人Z | 宝可梦中心前，打败哈乌后给予 剧情获得 |
| 谜拟QZ | 14号道路超值超市旧址内，完成谜拟Q剧情后拾得 备注：限定夜晚触发 |
| 索尔迦雷欧Z | 究极之日：收服索尔迦雷欧后，莉莉艾给予 备注：二周目 |
| 究极之月：带着露奈雅拉，去波尼古道的月轮祭坛，反转世界至日轮祭坛，之后去月轮湖取得科斯莫古后获得 备注：二周目 现实时间18:00~5:59 |
| 露奈雅拉Z | 究极之日：带着索尔迦雷欧，去波尼古道的日轮祭坛，反转世界至月轮祭坛，之后去日轮湖取得科斯莫古后获得 备注：二周目 现实时间18:00~5:59 |
| 究极之月：收服露奈雅拉后，莉莉艾给予 备注：二周目 |
